bioedit序列对比软件 v7.0.9

BioEdit是一个功能齐全的免费序列对比编辑器软件。对于分子生物学来说，是一款相当不错的应用工具了。主要可以完成核苷酸序列和蛋白质序列进行所有常规的分析操作，如：序列比对、序列检索、引物设计、系统发育分析等。这是由研究生设计和编写的鼠标驱动的，所以对于序列比对编辑器和序列分析程序，非常易于使用。而且他们深入理解如何依靠文字处理器和命令行程序进行序列操作。 提供了一个单一的程序，可以处理大多数简单的序列和比对编辑和操作功能，研究人员可能每天都会做，以及一些基本的序列分析。所以说，对于生物DNA序列分析来说，非常的有用。觉得需要的朋友，可以下载使用哦！

特色介绍

1、可以完全核苷酸序列和蛋白质序列进行所有常规的分析操作
2、序列比对、序列检索、引物设计、系统发育分析等
3、和DNAMAN 相比其分析内容相对更丰富一些

功能说明

1、手动对齐四种模式：选择和幻灯片，动态抓取和拖动，间隙插入和鼠标点击删除，以及在屏幕上的打字行为就像一个文本编辑器。
2、独立核酸和氨基酸颜色表的颜色对齐和编辑，并完全控制背景颜色。
3、用于从DNA序列自动生成质粒载体图的质粒绘图接口。轻松标记位置，添加箭头和弯曲框的功能，并标记限制性酶切位点。同时显示polylinker的细节，绘制可移动的箭头和绘图工具的形状。
4、动态的基于信息的对齐阴影。
5、点击颜色表编辑
6、显示和打印具有专业外观的ABI色谱图。
7、将序列分组成组或族。
8、为同步手对齐调整锁定分组序列的对齐。
9、在包含特征注释信息工具提示的对齐窗口中使用动态视图对具有图形特征的序列进行注释。
10、锁定序列以防止意外编辑。
11、在氨基酸和核苷酸序列中指定被认为有效的字符进行计算。
12、按照名称，LOCUS，定义，访问，PID / NID，参考，注释或选定列中的残留频率对序列进行排序。
13、通过参考序列合并对齐。
14、追加一个对齐到另一个的结尾。
15、基本的系统发育树查看器（phylip格式树），允许节点翻转和打印。
16、在单个序列编辑器中用字母读回序列来验证手工输入的序列条目。
17、读写Genbank，Fasta，Phylip 3.2，Phylip 4和NBRF / PIR格式。现在还读取GCG和Clustal格式
18、利用Don Gilbert的ReadSeq自动导入和导出另外11种格式，包括MSF，ASN.1，IG / Stanford和EMBL。
19、允许直接从剪贴板导入兼容格式，而不先保存到文件。
20、轻松定制编辑器窗口的菜单快捷键
21、RNA比较分析，包括协变，潜在配对和互信息分析（目前能够生成矩阵高达10,000 x 10,000 - 但这将是一个600 + Mb文件）与矩阵绘图仪的二维矩阵输出表和面积图数据矩阵的单独行。矩阵绘图仪和线图都具有点击数据选择，矩阵数据的矩阵绘图仪和一维线图现在是动态链接的

bioedit序列拼接教程

1、在BioEdit中开启一个序列
2、而后将序列上方的一个菜单：Mode下拉式菜单改为Edit，将光标移动到序列的最末端，从粘贴板上粘贴你要增加的第二个序列就OK了。这样三个序列都前后连接到一起了。
3、这需要一个一个来，十分麻烦。Mega5软件支持将比对后的序列一下子全部放到此外一个比对后的序列后面。因此在序列连接(或拼接)中，用Mega5比BioEdit更好。要注意的是使用Mega5做连接时，要选择Edit/Build alignment，不能是Edit/view选项，不然不能编辑。

Bioedit软件使用教程

开启Bioedit软件，FileOpen，开启上述比对后的fasta文件，即本例的123.fasta。模式(Mode)选择Edit，Overwrite;选择修改模式为右键插入，即I图标。对序列碱基进行编辑。删除序列使用键盘上的-键。编辑完成后，删除参考序列文件。

文件输出
点击FileSave As，保存为fasta格式，本例保存为123.fasta，覆盖旧文件。