DnaMan 9中文破解版
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DNAman破解版是一款专门用于开发的高度集成化的分子生物学应用软件,几乎可完成所有日常核酸和蛋白质序列分析工作,拥有多种分析功能,列如多序列比对、蛋白质分析、限制性酶切分析、质粒绘图、PCR 引物设计等。通过这款软件你可以便捷的分析各种复杂的运行,还可以直接模拟DNA运行状态。是生命科学工作者、研究人员所必备的工具之一。本软件支持的分析类型非常丰富,包括蛋白质分析、分子研究、引物分析、序列对比研究等模块,DNAMAN扫描所有的序列记录在默认的数据库搜索当前序列的同源序列。DNAMAN软件的数据库功能,允许用户组织DNA和蛋白质序列的不同科目。DNAMAN在许多同行评审的科学期刊中被高度引用的序列分析软件。DNAman 9破解版附带破解补丁,小编亲测可用,整合了破解教程可供参考,喜欢的朋友可以前来下载体验!
2、使用默认路径,一般储存为c盘,点击next
3、点击“install”进行安装
4、软件正在安装,请稍后
5、安装完成,点击finish推出安装界面
6、安装完成后将破解补丁替换到安装目录下的源文件即可
默认安装目录为:C:Program Files (x86)DNAMAN
选择数据库|经理命令打开数据库管理器”对话框。
2、错配分析
错配分析的目的是找到所有可能的退火位点的DNA序列的引物在默认。此功能可用于PCR和DNA测序的引物选择。权重矩阵用来区分引物位置的重要性。由于引物在3’末端对目标DNA的匹配比PCR扩增的5末端更重要,所以更多的权重被赋予3’末端。为了提高PCR引物的特异性,应始终检查引物与靶DNA之间是否存在次级退火位点。
3、DNA和蛋白质数据库
该软件的数据库功能,允许用户组织DNA和蛋白质序列的不同科目。
4、扫描序列的相似性
它扫描所有的序列记录在默认的数据库搜索当前序列的同源序列。如果默认数据库包含DNA序列,则默认序列必须是DNA序列。如果默认数据库包含蛋白质序列,则默认序列必须是蛋白质序列。DNAMAN将使用快速对准方法扫描数据库的序列相似性。您可以选择对结果的最终输出使用快速对齐或最佳对齐方式。
5、编辑记录信息
有关特定记录的信息可以编辑。在序列列表框中,所有记录按字母顺序或记录顺序列出。每个记录名字的数量显示记录的记录号ID.用DNAMAN自动分配。因此,您可以为不同的记录使用相同的名称。
6、两个引物互补
您可以使用DNAMAN检查两个寡核苷酸序列的互补性。 要执行此功能,第二个引物应通过选择引物|载入DNAMAN存储器 两个Primer互补命令。
7、从文本文件导入记录
从文本文件导入寡核苷酸序列是将大量oligo记录添加到数据库的便捷工具。
DNAMAN将记录的信息列入七个字段:名称,来源,备注,长度,GC含量,熔解温度和序列。如果数据库中有大量记录,则可以使用前四个字段作为排序键,以便在“记录列表”框中选择性地显示记录。
将待分析的序列装入Channel,点击要分析的Channel,然后通过Restriction/Analysis 命令打开对话框.
参数说明如下:
Results 分析结果显示
其中包括:
Show summary(显示概要) Show sites on sequence(在结果中显示酶切位点)
Draw restriction map(显示限制性酶切图)Draw restriction pattern(显示限制性酶切模式图)
Ignore enzymes with more than(忽略大于某设定值的酶切位点)
Ignore enzymes with less than(忽略小于某设定值的酶切位点)
Target DNA (目标DNA 特性)
circular(环型DNA),dam/dcm methylation(dam/dcm 甲基化)
序列的加载与比对
DNAMAN可以用来进行核酸和蛋白的多序列比对,为了方便比较,本文所用于比对的序列与《ESPript:美得令人心动的序列显示工具》相同。
首先,把要参与比对的序列加载到不同通道中。本文一次性把上次的“lala.aln”文件中的多条序列加载到多个通道中,方法见下图(当然,你也可以将单个序列文件逐一加载到通道中)。注意,打开文件的格式要改为“All Files”,点“否”载入的是蛋白序列。
接下来对导入的序列进行多序列比对,方法见下图,参数全部保持默认,点“下一步”就可以。
比对后的最终结果见下图:
2、以不同形式显示序列
通过Sequence|Display Sequence命令打开对话框,
根据不同的需要,可以选择显示不同的序列转换形式。对话框选项说明如下:
Sequence &Composition 显示序列和成分
Reverse Complement Sequence 显示待分析序列的反向互补序列
Reverse Sequence 显示待分析序列的反向序列
Complement Sequence 显示待分析序列的互补序列
Double Stranded Sequence 显示待分析序列的双链序列
RNA Sequence 显示待分析序列的对应RNA序列
Annotations 批注
Include 显示内容中包含批注
Lowercase 显示内容中包含批注(小写字母形式)
Only 显示内容中仅包含批注
Exclude 显示内容中不包含批注
3、DNA序列的限制性酶切位点分析
①将待分析的序列装入Channel,点击要分析的Channel,然后通过Restriction|Analysis命令打开对话框,
②如果选择了Draw restriction pattern,那么当所有的channel中共有两条DNA时,则只能选择两个酶分析,如果共有三个以上DNA时,则只能用一个酶分析。
③选择所需的项目,然后按提示操作点击“下一步”按扭,出现下列酶选择对话框:
④选择多种酶(例如puc18 multiple cloning sites),然后点击按钮出现下列对话框:
⑤输入要保存酶列表的文件名,点击“OK”按钮即可保存。自制酶列表可以方便分析一段序列是否含有特定的酶切位点群。
破解教程
1、下载然后解压数据包,双击运行“DNAMAN 9.exe”2、使用默认路径,一般储存为c盘,点击next
3、点击“install”进行安装
4、软件正在安装,请稍后
5、安装完成,点击finish推出安装界面
6、安装完成后将破解补丁替换到安装目录下的源文件即可
默认安装目录为:C:Program Files (x86)DNAMAN
软件功能
1、数据库管理选择数据库|经理命令打开数据库管理器”对话框。
2、错配分析
错配分析的目的是找到所有可能的退火位点的DNA序列的引物在默认。此功能可用于PCR和DNA测序的引物选择。权重矩阵用来区分引物位置的重要性。由于引物在3’末端对目标DNA的匹配比PCR扩增的5末端更重要,所以更多的权重被赋予3’末端。为了提高PCR引物的特异性,应始终检查引物与靶DNA之间是否存在次级退火位点。
3、DNA和蛋白质数据库
该软件的数据库功能,允许用户组织DNA和蛋白质序列的不同科目。
4、扫描序列的相似性
它扫描所有的序列记录在默认的数据库搜索当前序列的同源序列。如果默认数据库包含DNA序列,则默认序列必须是DNA序列。如果默认数据库包含蛋白质序列,则默认序列必须是蛋白质序列。DNAMAN将使用快速对准方法扫描数据库的序列相似性。您可以选择对结果的最终输出使用快速对齐或最佳对齐方式。
5、编辑记录信息
有关特定记录的信息可以编辑。在序列列表框中,所有记录按字母顺序或记录顺序列出。每个记录名字的数量显示记录的记录号ID.用DNAMAN自动分配。因此,您可以为不同的记录使用相同的名称。
6、两个引物互补
您可以使用DNAMAN检查两个寡核苷酸序列的互补性。 要执行此功能,第二个引物应通过选择引物|载入DNAMAN存储器 两个Primer互补命令。
7、从文本文件导入记录
从文本文件导入寡核苷酸序列是将大量oligo记录添加到数据库的便捷工具。
DNAMAN将记录的信息列入七个字段:名称,来源,备注,长度,GC含量,熔解温度和序列。如果数据库中有大量记录,则可以使用前四个字段作为排序键,以便在“记录列表”框中选择性地显示记录。
常见问题
1、DNAman怎么分析序列的酶切位点:将待分析的序列装入Channel,点击要分析的Channel,然后通过Restriction/Analysis 命令打开对话框.
参数说明如下:
Results 分析结果显示
其中包括:
Show summary(显示概要) Show sites on sequence(在结果中显示酶切位点)
Draw restriction map(显示限制性酶切图)Draw restriction pattern(显示限制性酶切模式图)
Ignore enzymes with more than(忽略大于某设定值的酶切位点)
Ignore enzymes with less than(忽略小于某设定值的酶切位点)
Target DNA (目标DNA 特性)
circular(环型DNA),dam/dcm methylation(dam/dcm 甲基化)
dnaman使用教程
1、如何用DNAMAN导出序列比对图?序列的加载与比对
DNAMAN可以用来进行核酸和蛋白的多序列比对,为了方便比较,本文所用于比对的序列与《ESPript:美得令人心动的序列显示工具》相同。
首先,把要参与比对的序列加载到不同通道中。本文一次性把上次的“lala.aln”文件中的多条序列加载到多个通道中,方法见下图(当然,你也可以将单个序列文件逐一加载到通道中)。注意,打开文件的格式要改为“All Files”,点“否”载入的是蛋白序列。
接下来对导入的序列进行多序列比对,方法见下图,参数全部保持默认,点“下一步”就可以。
比对后的最终结果见下图:
2、以不同形式显示序列
通过Sequence|Display Sequence命令打开对话框,
根据不同的需要,可以选择显示不同的序列转换形式。对话框选项说明如下:
Sequence &Composition 显示序列和成分
Reverse Complement Sequence 显示待分析序列的反向互补序列
Reverse Sequence 显示待分析序列的反向序列
Complement Sequence 显示待分析序列的互补序列
Double Stranded Sequence 显示待分析序列的双链序列
RNA Sequence 显示待分析序列的对应RNA序列
Annotations 批注
Include 显示内容中包含批注
Lowercase 显示内容中包含批注(小写字母形式)
Only 显示内容中仅包含批注
Exclude 显示内容中不包含批注
3、DNA序列的限制性酶切位点分析
①将待分析的序列装入Channel,点击要分析的Channel,然后通过Restriction|Analysis命令打开对话框,
②如果选择了Draw restriction pattern,那么当所有的channel中共有两条DNA时,则只能选择两个酶分析,如果共有三个以上DNA时,则只能用一个酶分析。
③选择所需的项目,然后按提示操作点击“下一步”按扭,出现下列酶选择对话框:
④选择多种酶(例如puc18 multiple cloning sites),然后点击按钮出现下列对话框:
⑤输入要保存酶列表的文件名,点击“OK”按钮即可保存。自制酶列表可以方便分析一段序列是否含有特定的酶切位点群。
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