引物设计软件Oligo 7.37 破解版

Oligo 7破解版是一款强大的引物设计软件，也是目前最好的最专业的引物设计软件，Oligo的功能很强，比如能够对普通引物对进行搜索，测试引物的设计，杂交探针的设计等等，能够很好的生物科学领域的用户完成许多的实验和应用。Oligo 7破解版基于最接近林热力学和质量的数据，帮助用户寻找最佳音舞，包括TaqMan、高度多路复用等等，还恩那个狗通过多个文件的批处理完成定向透变，是众多生物学从业者必不可少的工具。

安装破解教程

1、首先自然是运行安装程序安装我们的Oligo 7破解版。

2、选择安装路径，建议用户安装在C盘不要变，因为还需要破解。

3、点击“next”，然后就是创建桌面快捷方式。

4、然后一直点击next，知道安装完成。

5、安装完成运行软件和注册机。

6、不要管上面的东西，将Workstation Code输入到注册机的相应位置，也可以复制过去。

7、然后点击Generate，将生成的Access Code复制到注册界面的相应位置，然后点击Confirm Code，完成后用户就可以使用了。

Oligo 7破解版使用方法

1、首先，同Oligo 6 一样，File菜单下，选择New sequence ,打开窗口将目的序列粘贴进来，或是选择Open定位到目的cDNA序列（在primer中，该序列已经被保存为Seq文件），这是最初打开时的界面：

2、然后就是进行引物的设计了。Search 菜单下，选择for primes &probes ,即出现引物搜寻窗口:

3、根据自己的实际情况选择Parameters 或Ranges设置引物的相关参数和范围。然后选择Search即开始进行引物的搜索，之后会出现软件所列出的依据得分（Score）高低排列设计的引物。

4、双击每一行所列出的引物会弹出该对引物的具体信息，以及软件对该对引物的相关评价。

5、双击之后在最初的Sequence 窗口中就会出现下面的窗口:

6、点击绿色方形图标前面的i标志可了解对应的具体信息。

7、之后便是对该引物的具体分析了，这部分的分析同Oligo 6基本上是一样的。 选择Analyze菜单，如下图：

8、Analyze的选项介绍
（1）Analyze中，第一项为Key info，点击Selected primers，会给出两条引物的概括性信息，其中包括引物的Tm值，此值Oligo是采用nearest neighbor method计算，会比Primer5中引物的Tm值略高，此窗口中还给出引物的Delta G和3’端的Delta G.3’端的Delta G过高，会在错配位点形成双链结构并引起DNA聚合反应，因此此项绝对值应该小一些，最好不要超过9。    （2）Analyze中第二项为Duplex Formation，即二聚体形成分析，可以选择上游引物或下游引物，分析上游引物间二聚体形成情况和下游引物间的二聚体情况，还可以选择Upper/Lower ，即上下游引物之间的二聚体形成情况。引物二聚体是影响PCR反应异常的重要因素，因此应该避免设计的引物存在二聚体，至少也要使设计的引物形成的二聚体是不稳定的，即其Delta G值应该偏低，一般不要使其超过4.5kcal/mol，结合碱基对不要超过3个。Oligo此项的分析窗口中分别给出了3’端和整个引物的二聚体图示和Delta G值。    （3）Analyze中第三项为Hairpin Formation，即发夹结构分析。可以选择上游或者下游引物，同样，Delta G值
不要超过4.5kcal/mol，碱基对不要超过3个。     （4）Analyze中第四项为Composition and Tm，会给出上游引物、下游引物和产物的各个碱基的组成比例和Tm值。上下游引物的GC％需要控制在40％～60％，而且上下游引物之间的GC％ 不要相差太大。Tm值共有3个，分别采用三种方法计算出来，包括nearest neighbor method、％GC method和2(A＋T)＋4(G＋C)method，最后一种应该是Primer5所采用的方法，Tm 值可以控制在50～70度之间。    （5）第五项为False Priming Sites，即错误引发位点，在Primer5中虽然也有False priming分析，但不如oligo详细，并且oligo会给我正确引发效率和错误引发效率，一般的原则要使误引发效率在100以下，当然有时候正确位点的引发效率很高的话，比如达到400～500，错误引发效率超过100幅度若不大的话，也可以接受。    （6）Analyze中，有参考价值的最后一项是“PCR”，在此窗口中，是基于此对引物的PCR反应Summary，并且给出了此反应的最佳退火温度，另外，提供了对于此对引物的简短评价。若该引物有不利于PCR反应的二级结构存在，并且Delta G值偏大的话，Oligo在最后的评价中会注明，若没有注明此项，表明二级结构能值较小，基本可以接受。
 (7)另外，Internal stability也很重要，最好是中间高两边低的弧形。